明朝西厂督主雨化田(陈坤饰)为了追捕怀了龙胎的妃嬪素慧容（范晓萱饰）下落逃开皇宫外，素慧容（范晓萱饰）逃亡中得侠女凌雁秋（周迅饰）救走，两人路过的正是龙门客栈，相传“龙门”是三百年前西夏王国神秘失踪之地点，每六十年必有一场巨大的沙尘暴，之后皇宫大门会破沙而出，那裡会找到失落的宝藏。客栈之内可说卧虎藏龙，有韃靼女子布鲁嘟（桂纶镁饰）领头之韃靼队伍，有女侠打扮的顾少棠（李宇春饰）及专门买卖江湖消息的胡中玉，而胡中玉竟长得与雨化田一个模样！

而多年未露面的赵怀安（李连杰饰）亦同时神秘现身！此时，谭鲁子带领之西厂队伍追踪而至，泷人决定使计让胡中玉穿上官服装成雨化田，让赵怀安乘机用箭阵杀敌！

可是就在此际，真的雨化田赶到，各路英雄狭路相逢相聚龙门客栈，而十几条龙捲风向龙门客栈旋转而来！